柯南和小五郎等拉着大队，园产来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，园产大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
回复 :故事发生在风和日丽的神仙村里，奇奇（刘艺 配音）和美美（郝琳杰 配音）是住在村里的两个小神仙。奇奇个性活泼开朗，对一切都充满了好奇心，奇奇最害怕的就是无聊，因此，他总是想方设法的找各种各样稀奇古怪的事情来打发时间，这期间自然惹出了不少的麻烦，也闹了不少的笑话。美美喜欢幻想，为了体验不同的生活，她一会儿变身成为歌星，一会儿又当上了模特，兴趣爱好更是千奇百怪，常变常新。村长老神仙十分喜爱奇奇和美美这两个聪明伶俐的小神仙，他告诉两人，唯有一心一意，同心协力，才有可能办成大事。神仙村充满了幸福和快乐的日常还在继续。
回复 :某天，柯南因感冒在家休息，期间接到了灰原哀的电话。原来灰原做出了APTX-4869的最新解药，虽然只是试制品，但一心恢复工藤新一身份的柯南仍然迫不及待赶往阿笠博士的实验室。服药后，新一终于回到原有状态，不过周遭的一切却似乎有所改变：博士院子里的树长高了，出现许多新的建筑物，体育老师变得苍老，班里的同学全是陌生面孔，甚至元太、光彦和步美也都变成高中生的模样。他找到同样变成高中生的灰原，得知自己在过去的10年里不断服用解毒药导致产生抗药性，最近5年已无法变会原有状态。失落的柯南无奈看着周遭的转变，更让他倍受打击的是，小兰决定放弃杳无音讯的新一而嫁给新出老师。他们的恋情亦梦以幻，何以为终……
回复 :风景如画的清河镇边上已经不知道什么时候来了一只猫，和他一起的还有一只牡羊，他和猫都一样失去了记忆，这只猫身上似乎有着神秘的诅咒，所有靠近他们的人都会受到诅咒，这只猫却又努力的想要与村人接近，但因为诅咒，所有的村人都避开他在漫长的日子中，星猫和牡羊卷毛不断地回忆自己的过往，就这样渡过了很长的时间，直到有一天他们接近村子附近的一座古塔，遭遇到了小黑怪手下的绑架并得知了他们的身世之谜，自此展开了他们的冒险旅行…
