延续前一集的剧情，花儿狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、花儿斑马马蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 David Schwimmer 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 Jada Pinkett Smith 配音）以及企鹅们，为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约，对一架破旧的失事飞机进行维修改造，并成功起飞。当大家已经开始庆祝终于可以回到纽约时，飞机却意外降落，迫降到了非洲大草原上。在这儿，狮子亚历克斯终于见到了它的父母。但是由于生活习性上太多不一样，而且言行举止各异，使得这群纽约来的动物们显得格格不入。这群昔日纽约中央公园的动物明星们，在这野外艰难的环境中应该怎么办？虽然在这儿遇见了自己的同类，但因为习性不同，使得自己无法完全融入他们的群体。为了能融入环境，与同类们建立良好的关系，大家都是施展各种招式，笑料百出。
回复 :彼得（下野紘 配音）是隶属于亚格巴契战士公会的战士，曾经在武斗祭上夺得头筹，被誉为地表最强人类。彼得的最大梦想就是能够成为世界上最强的男人，然后迎娶自己的青梅竹马露薇莉亚（二之宫唯 配音），现在，他离实现梦想仅剩最后一步了。 然而，让彼得没有想到的是，自己所拥有的强大力量和高涨的人气吸引了各族女子慕名而来，她们都想获得继承了这强大基因的孩子。古灵精怪的鬼人族姐妹莉莎（山村响 配音）和美美（竹达彩奈 配音）、性格高傲总是拿鼻孔看人的高等精灵薇绀（上原明里 配音）、个性非常内向，总是缺乏自信的兽人皮格莉特（千本木彩花 配音），这些女子们为了争夺彼得的种子开始了较量。
回复 :结城梨斗（渡边明乃 配音）尽管沉默寡言，但拥有一颗温柔善良的内心。内向的他暗恋名叫西连寺春菜（矢作纱友里 配音）的女孩，然而，他选择了把真挚的感情藏在心底，只是偷偷看着她已解相思之苦。终于，梨斗再也无法抑制内心的感情，他鼓起勇气，决定向春菜告白，然而，一连串意外的发生让他的告白对象变成了名为菈菈（户松遥 配音）的女子，更加匪夷所思的是，菈菈的真实身份竟然是戴比路克星的外星公主。就这样，梨斗开始了和菈菈“斗智斗勇”的生活，随之而来的不仅仅是接踵而至的各路麻烦，竟然还有尾随菈菈而来的危险外星杀手，面对这样的险境，梨斗还能愉快的玩耍吗？
回复 :《圆盘皇女3》讲述生长在瓦尔哈那行星的美丽公主瓦尔古雷，为了逃避所谓的政治婚姻，从行星出逃了。当她即将在地球降落时，UFO飞船因为失控，冲向了时乃汤，压倒了和人 为了挽救和人的生命，瓦尔古雷将自己最重要的东西灵魂的一半分给了和人，然而自己因为超能力的减弱，变成了非常可爱的小女孩。在意识模糊 之时，和人看到了还没变小的瓦尔古雷，心仪不已。就这样，瓦尔古雷与和人一起住在时乃汤。
